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12月1日-2日,由浙江大學(xué)農(nóng)生環(huán)測試中心主辦,杭州寶誠生物技術(shù)有限公司與Oxford NanoporeTechnologies聯(lián)合承辦的“單細(xì)胞納米孔長讀長測序技術(shù)研討會” 圓滿落幕。
本次研討會上,來自單細(xì)胞不同研究領(lǐng)域的科學(xué)家們進(jìn)行了專題報告,分享了他們利用納米孔測序進(jìn)行單細(xì)胞相關(guān)研究的成果,內(nèi)容涵蓋了空間組學(xué)、癌癥研究、微生物、人類基因組、創(chuàng)新方法學(xué)研究等多個應(yīng)用領(lǐng)域,本次會議共吸引了一百五十余位專家,共同探討學(xué)習(xí)單細(xì)胞納米孔測序技術(shù)應(yīng)用的現(xiàn)狀與未來。
精彩回顧
——
鄭紹建教授致辭
浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院學(xué)部副部長
浙江省植物生理與植物分子生物學(xué)學(xué)會理事長
鄭紹建教授為大會做開幕致辭。鄭紹建教授對杭州寶誠生物技術(shù)有限公司在生命科學(xué)領(lǐng)域新技術(shù)的引進(jìn)與推廣方面做出的貢獻(xiàn)給予了高度的評價,希望通過本次研討會,推進(jìn)單細(xì)胞測序技術(shù)發(fā)展,促進(jìn)納米孔測序技術(shù)實際應(yīng)用,提升學(xué)術(shù)及數(shù)據(jù)分析水平。
浙江大學(xué)農(nóng)生環(huán)測試中心副主任王華教授
寶誠生物董事長施覺亮先生
一起聽取大會報告
從單細(xì)胞到空間單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄組測序
在癌癥耐藥研究中的應(yīng)用
田魯亦研究員
廣州國家實驗室
田魯亦研究員系統(tǒng)性地介紹了從單細(xì)胞到空間單細(xì)胞領(lǐng)域的基礎(chǔ)技術(shù)路線,分享了其團(tuán)隊基于單細(xì)胞納米孔測序技術(shù)開發(fā)的分析工具Flames以及通過納米孔全長轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)癌癥耐藥相關(guān)突變以及機(jī)制研究,同時分享了空間轉(zhuǎn)錄組測序的相關(guān)案例。
納米孔與單細(xì)胞結(jié)合帶來的機(jī)會與挑戰(zhàn)
陳磊研究員
上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)附屬仁濟(jì)醫(yī)院
陳磊研究員詳細(xì)介紹了與傳統(tǒng)測序技術(shù)相比較,納米孔長讀長測序技術(shù)為單細(xì)胞測序帶來了新的可能。報告指出,納米孔測序技術(shù)結(jié)合單細(xì)胞能夠鑒定更多的轉(zhuǎn)錄物/轉(zhuǎn)錄物異構(gòu)體,更精細(xì)的聚類,更準(zhǔn)確的區(qū)分轉(zhuǎn)錄物和假基因等。
基于Oxford Nanopore平臺的單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄組測序
嚴(yán)舒琪女士
牛津納米孔技術(shù)應(yīng)用專家
嚴(yán)舒琪女士首先介紹了納米孔長讀長測序技術(shù)在單細(xì)胞以及空間組學(xué)研究領(lǐng)域可以揭示在常規(guī)短讀長測序技術(shù)中丟失的新維度信息,包含全長轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)、可變剪切、融合基因等,同時嚴(yán)舒琪女士系統(tǒng)性回顧了納米孔測序在單細(xì)胞領(lǐng)域以及空間組學(xué)的應(yīng)用研究,介紹了單細(xì)胞平臺加納米孔測序平臺加分析的整體解決方案。
單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄組解析腫瘤細(xì)胞異質(zhì)性
龔亮研究員
浙江大學(xué)良渚實驗室
龔亮研究員的報告詳細(xì)介紹了前沿的納米孔測序技術(shù)結(jié)合單細(xì)胞測序,相對二代短讀長測序技術(shù)可以更好地對腫瘤細(xì)胞異質(zhì)性進(jìn)行解析,尤其通過全長RNA測序可以提供更高分辨率的細(xì)胞亞群鑒定,可以更好地鑒定新基因或者新轉(zhuǎn)錄本。
高通量測序技術(shù)的應(yīng)用和挑戰(zhàn)
毛偉華教授
浙江大學(xué)農(nóng)生環(huán)測試中心
毛偉華教授系統(tǒng)性介紹了測序技術(shù)的發(fā)展歷程以及浙大農(nóng)生環(huán)分析測試中心的測序平臺,其中重點介紹了納米孔測序技術(shù)超長讀長、直接測序、實時測序等技術(shù)優(yōu)勢,以及利用浙大農(nóng)生環(huán)測序中心納米孔測序平臺幫助浙大師生合作完成的科研成果,包括在微生物基因組測序和植物全長CircRNA測序等領(lǐng)域的應(yīng)用案例。
MobiNova?跨平臺、多物種單細(xì)胞多組學(xué)解決方案
王夢心女士
墨卓生物高級產(chǎn)品經(jīng)理
王夢心女士介紹到,墨卓MobiNova?-100單細(xì)胞測序建庫系統(tǒng),基于分子標(biāo)簽(barcode)的單細(xì)胞識別,利用獨家專利的標(biāo)簽和油包水技術(shù),可對多種樣本自動完成單細(xì)胞分離、細(xì)胞裂解、核酸捕獲,是高質(zhì)量、端到端的高通量單細(xì)胞測序建庫系統(tǒng)。
數(shù)據(jù)實操
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納米孔測序以其“超長讀長、直接DNA/RNA測序、實時測序、操作簡單”等優(yōu)勢受到科研與臨床等各研究領(lǐng)域?qū)<业母叨汝P(guān)注。但是數(shù)據(jù)分析一直是很多科學(xué)家較為關(guān)心的話題,本屆單細(xì)胞研討會特別聯(lián)合及智(蘇州)醫(yī)學(xué)技術(shù)有限公司的專業(yè)生信團(tuán)隊,開展單細(xì)胞納米孔測序數(shù)據(jù)分析實操培訓(xùn)班,帶領(lǐng)大家完成了二代單細(xì)胞與三代全長轉(zhuǎn)錄本合并分析,此次培訓(xùn)班包含擬時序、組間差異、富集分析、轉(zhuǎn)錄本關(guān)聯(lián)膜蛋白、分泌蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等一系列分析,同時并就單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)特點及分析難點進(jìn)行了全面透徹的解析。
單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄測序分析技術(shù)測評
陳磊研究員
上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)附屬仁濟(jì)醫(yī)院
單細(xì)胞全長測序:cDNA水平的單細(xì)胞遺傳變異研究
程小濤總經(jīng)理
及智(蘇州)醫(yī)學(xué)技術(shù)有限公司
基于單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄組的抗體、核酸藥物研發(fā)策略
梁輝常務(wù)副所長
蘇州思萃免疫技術(shù)研究所
生信培訓(xùn)現(xiàn)場學(xué)員照片
至此,本次研討會順利結(jié)束,希望通過本次研討會,為大家?guī)碜顭衢T、最前沿的單細(xì)胞研究,推進(jìn)納米孔長讀長測序在單細(xì)胞領(lǐng)域的應(yīng)用,期待未來與各位專家學(xué)者更多的交流與合作。
合影留念
寶誠生物集團(tuán)創(chuàng)立于1997年7月,在生命科學(xué)和大健康領(lǐng)域中致力于引進(jìn)、推廣國內(nèi)外先進(jìn)技術(shù)與產(chǎn)品,是一家集技術(shù)開發(fā)與推廣、產(chǎn)品銷售、售后服務(wù)等為一體的綜合發(fā)展的高科技公司,與全球最前沿的著名企業(yè)如Bio-Rad、Danaher集團(tuán)、LONZA、Waters、Nanopore、Abcam、Nanolive、3D Histech、杭州柏熠等建立了良好的合作關(guān)系??偛吭O(shè)立于浙江杭州,在江蘇、安徽、江西、福建、湖北等地設(shè)立了分公司或辦事處。
公司努力追蹤生命科學(xué)領(lǐng)域的最新技術(shù)和發(fā)展,長期舉辦各種技術(shù)培訓(xùn)和講座,將全球先進(jìn)的技術(shù)和產(chǎn)品推薦給國內(nèi)用戶,使國外最新的研發(fā)技術(shù)能盡快地服務(wù)于廣大科研人員。自成立以來,一直遵循“誠實、誠懇、誠信”的價值觀和為客戶提供最先進(jìn)的研究工具和整體解決方案的使命,憑借自身先進(jìn)的經(jīng)營理念、雄厚的綜合實力、卓越的人才隊伍、優(yōu)秀的團(tuán)隊管理等方面的優(yōu)勢,與各大高校、科研院所、醫(yī)院、政府實驗室、生物制藥等生命科學(xué)和化工領(lǐng)域的用戶建立了良好的合作關(guān)系,也得到了廣大用戶的認(rèn)可和支持,在同行及用戶中樹立了良好的信譽(yù)和口碑。
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